業務内容
我々はパートナーである大手企業との共同研究や自社研究において様々な大規模ゲノム改変細胞を作製しておりますが、ゲノム編集技術の正確性を検証する目的や細胞の表現型を解析する上で次世代シークエンサー(NGS)解析が重要な技術です。弊社が行っている様々なNGS解析を中心としてバイオインフォマティクス業務をご担当いただきます。
・Quality evaluation of genome-edited cells using Whole Genome Sequence analysis (analysis of fastq.gz read data).
・RNA-seq analysis, pathway analysis, scRNA-seq analysis, ATAC-seq analysis, and Perturb-seq analysis targeting human cells.
・Optimization of genome design using machine learning, deep learning, and large language models.
・Building and fine-tuning a transformer-based biological foundation model.
・Utilization and management of AWS cloud servers.
・Utilization of lab automation (automated cell culture system).
■想定される業務内容
・Whole Genome Sequence解析によるゲノム編集細胞の品質検査(fastq.gzリードデータの解析)
・ヒト細胞を対象としたRNA-seq解析/パスウェイ解析/scRNA-seq解析/ATAC-seq解析/Perturb-seq解析
・機械学習・深層学習・大規模言語モデルによるゲノムデザインの最適化
・トランスフォーマーベースの生物基盤モデルの構築やファインチューニング
・AWSクラウドサーバーの利用・運用
・ラボオートメーション(自動細胞培養装置)の活用